Projekt algas aastal 2001: 1999. aastal anti Ameerika Ühendriikidelt Panama ametivõimudele üle kontroll Panama kanali üle ja samal ajal tekkis küsimus külgnevate territooriumide uue kasutamise kohta. Üks sektsioonidest, mida varem hõivas Ameerika lennubaas, eraldati muuseumi jaoks. Ehitust alustati 2006. aastal, kuid alles oktoobri alguses avas Biomuseo üldsusele - ehkki veel mitte täielikult: mitu saali ja akvaarium valmivad alles 2016. aasta talvel.
Värvika alumiiniumkatusega muuseum peaks meenutama Panama elavat loodust, kohalike onnide metallkatuseid ja kanali infrastruktuuri ajaloolisi struktuure. Lahe välja ulatuval kitsal poolsaarel paiknev hoone on kaugelt nähtav ja võib ise pakkuda oma külastajatele panoraamvaateid linnale ja Vaikse ookeani "suu" Panama kanalile.
Muuseumi ehitamise kestust, mida kohalikud hüüdnimega "muuseum ei saa kunagi valmis", selgitab muu hulgas kohalike ehitajate madal kvalifikatsioon. Põrandate ja seinte karedat betooni tuli mitu korda uuesti valada ning ka 6 mm tolerantsidega katus valmistas palju raskusi.
Kuid nüüd pole muuseum mitte ainult edukalt ehitatud, vaid peaaegu täielikult täidetud näitusega "Elu sild", mille kujundas Bruce Mau. Washingtoni Smithsoniani institutsioon vastutas projekti teadusliku poole eest ja Biomuseost sai selle ainus partnermuuseum väljaspool USA-d.
Muuseum on pühendatud Panama maakitsuse hämmastavale looduslikule mitmekesisusele: 75 000 km2 suuruse alaga elab seal rohkem linnuliike, imetajaid, roomajaid ja taimeliike kui Ameerika Ühendriikides ja Kanadas kokku. Lisaks räägib ekspositsioon üksikasjalikult 12 miljonit aastat tagasi alanud ja 3 miljonit aastat tagasi lõppenud kannuse moodustumise protsessist. Selle välimus muutis ökosüsteeme ja kliimat planeedilises plaanis: ühe ookeani asemel tekkis hoopis teistsugune Atlandi ja Vaikne ookean, Golfi hoovus „algas“tärkavalt Kariibi merelt ning Põhja- ja Lõuna-Ameerika ühinesid esmakordselt 70 miljoni inimesega aastat. Loomade aktiivne ränne algas mööda kannust ja suhteliselt hiljuti, 15 000 aastat tagasi, läbisid esimesed inimesed selle tee põhjast lõunasse.
Biomuseo, mis läks maksma 95 miljonit dollarit (arvestamata veel lõpetamata näitusesaalide kulusid), on mõeldud peamiselt koolilastele (sinna plaanitakse tasuta ekskursioonideks tuua 40 000 õpilast aastas) ja turistidele, kuna kruiisilaevade terminal on väga lähedal. Ideaalis ootavad võimud muuseumilt "Bilbao efekti". Nende plaani kohaselt peaks sellest saama sama Panama-linna ja Panama-riigi sümbol, millest sai Utsoni ooperimaja Sydney ja Austraalia jaoks.
