Kompleksi rikkalik arhitektuuriajalugu algas esimese muuseumihoone valmimisega, mille 1939. aastal ehitasid Philip L. Goodwin ja Edward Durell Stone, ning selgus kohe, et ruumi pole piisavalt. Philip Johnson ehitas MOMA jaoks kaks täiendavat hoonet - 1951. aastal (nüüd lammutatud) ja 1964. aastal. Cesar Pelli lisas kompleksi näitusepinnad, samuti 52-korruselise elamu "Muuseumitorni".
Taniguchi, kes töötas koos rekonstrueerimisprojektiga koos Kon Pedersen Foxi bürooga, püüdis säilitada kõik eelmise ümberkorraldamise jäljed, tuues neis esile ootamatud nurgad.
Hoolimata asjaolust, et 20. sajand on möödas ja pikka aega on moodsaimat kunsti eksponeeritud Guggenheimi muuseumis, ei pööranud arhitekt hoones intensiivset tulevikku. Vastupidi, seinte rõhutatud lineaarsus ja siledad pinnad annavad selle ajaloolise kogemuse terviklikkuse edasi.
Uuele hallist klaasist ja mustast graniidist fassaadiga fuajeele eelneb erineva aja hoonete ansambel. Seestpoolt mööda valgeid veerude rida sisenedes siseneb külastaja tohutusse aatriumi, mille ümber on koondunud kõigi kuue korruse näitusegaleriid. Fuajee kaugemas seinas asuvad valgussillad ühendavad saale erinevatel tasanditel.
Hilisemad teosed asuvad 20. sajandi kunsti madalamates astmetes, varajases tingimusteta klassikas - tipus.
Kui külastaja vaatab saalide ülemiselt astmelt alla, näeb ta valguse seas ja justkui lahustub õhuarhitektuuris konkreetse perioodi kõige olulisemad tööd. Taniguchi juurdeehituse ühe fassaadi klaasist seina vaadates on Rodini Balzaci ja Itaalia sportautod korraga nähtavad erineva tasemega galeriides.
Erilise koha muuseumi ansamblis on fuajee klaasseina taga asuv aed koos nutuvate kaskede ja marmorsildadega. See asub madalatel terrassidel, mis annavad sellele avara tunde. Koos uue kuuekorruselise hoonega avanevad aeda ka vanad hooned, kus nüüd asub hariduskeskus, filmiraamatukogu ja fotoarhiiv.
